8月29日下午方舟子在家中接受两名电视记者采访，在将记者送上出租车后，回家途中，遭遇两名身份不明歹徒袭击。
各方评说方舟子
孙云晓(作家、教育学家)：“保护方舟子就是保护文明。方舟子如有不测将是今日中国的耻辱，是我们每一个人的耻辱。”
徐小平(新东方创始人之一)：“袭击方舟子，等于是向文明社会宣战，是对事实和真相的攻击，是对社会良知和准则的攻击。我知道我的谴责很无力，但我呼吁北京警方全力缉拿罪犯，并将进展公布于众。”
柴静(央视记者)：“暴力想让人恐惧，但暴力的实质才是恐惧，它没有说理的能力，只能恫吓，这是何等虚弱的内心。”
闾丘露薇(凤凰卫视记者)：“公民被打，执法机构都有责任调查，缉拿凶手，司法机构都有责任给予违法者法律制裁，不管是因为私人恩怨纠纷还是打击报复。而方舟子被打，因为他一直做的事情很明显是属于公共事件，更需要给公众一个真相。”
